FullMetal conta a história de dois irmãos, Edward e Alphonse. Eles
vivem num mundo onde existe a Alquimia. Esta, por sua vez, é a ciência
que estuda a transformação da matéria. Em outras palavras, como criar
alguma coisa a partir de outra já existente. Um exemplo de uso da
alquimia, seria fazer uma lança com um pouco de ferro. A Alquimia é
regida por uma série de leis. Uma delas, a mais importante, é a da
Troca Equivalente, que diz que você não pode criar alguma coisa a
partir do nada. Para tudo, sempre haverá um preço.

Para usar a alquimia, é necessário o uso de um círculo de
transmutação, que pode ser desenhado onde necessário. Na história,
Edward consegue fazer a alquimia sem o uso desse círculo, sendo
considerado por muitos como especial. Quando Edward tinha 8 anos (seu
irmão Alphonse tinha 7 anos nessa época), a mãe dele morreu. Com isso,
os irmãos Elric passaram a estudar a alquimia a fim de trazer sua mãe
de volta. Contudo, a chamada "Transmutação Humana" é um dos maiores
tabus na alquimia. Quando usaram a transmutação para reviver sua mãe,
Edward perdeu a perna esquerda e Alphonse perdeu seu corpo inteiro.
Edward, então, com a ajuda da alquimia fixou a alma de Alphonse em uma
armadura, em troca de seu braço direito. Por causa do acidente, Edward
usa uma prótese mecânica no lugar de sua perna e uma no lugar de seu
braço, chamadas de Automails.

A partir de então, o objetivo dos dois é recuperar seus corpos. Para
isso, Edward deseja encontrar a Pedra Filosofal. Eles não sabem se ela
realmente existe, mas de acordo com as histórias, a Pedra Filosofal
ampliaria o poder de um alquimista, de tal forma que ele poderia
ignorar a Lei da Troca Equivalente.

A história se baseia na busca dos irmãos Elric pela pedra filosofal, além da descobertas de vários segredos.

Muitos fãs não gostaram desse anime, exatamente porque ele precisou
seguir uma linha diferente da linha seguida pelo mangá. Rumores diziam
que o anime teria uma continuação, mas nada ainda era comprovado.

Finalmente, no final de 2008
a produtora confirmou que o anime seria refeito. Contudo, ao contrário
do que muitos pensavam, esse novo anime não seria uma continuação do
primeiro, mas sim um anime refeito totalmente do zero e o principal,
totalmente fiel ao mangá. Essa nova série posteriormente foi denominada
de Brotherhood nos Estados Unidos. Sua criação só foi possível, entre outros motivos, porque Hiromu avisou que o mangá não deveria passar do volume 100.

Com isso, em 2009 Fullmetal Alchemist Brotherhood foi lançado, estando atualmente no episódio 8. Os episódios são lançados todos os domingos no Japão.