Com onze meses de idade, sua mãe a levou para fazer comerciais. Aos quatro anos, foi escalada para a novela One Life to Live em 1993, onde permaneceu até 1997. Desde então, tem aparecido em vários filmes e séries de Tv. No cinema, Hayden iniciou no filme Remember the Titans, em 2000 e Joe Somebody, no ano seguinte. Participou de vários filmes de animação, como A Bug’s Life, e em seguida Dinosaur. Esteve também em Racing Stripes onde atuou junto com personagens de animação. Atualmente faz o seriado Heroes, onde interpreta a líder de torcida Claire Bennet, que tem o poder de se curar e de se regenerar rapidamente. Está namorando Milo Ventimiglia (Peter Petrelli), outro ator do elenco de Heroes. Os dois estão juntos há alguns meses. Hayden também fez a voz de Kairi, uma das atrizes principais de Square Enix/Disney’s Kingdom Hearts. Outro projeto atual de Hayden é seu album musical. Hayden atualmente vive em Palisades, Nova York com seus pais e seu jovem irmão, Jansen, mas viaja frequentemente para fazer filmes e músicas. Ela também mora em Los Angeles, California.