Na série, há vários códigos, também chamados de glifos curiosos que não alteram a mitologia da série, porém, segundo o criador da série J. J. Abrams, eles "tem um significado secreto", e cada episódio tem uma série de glifos que são mostrados durante os intervalos comerciais, que quando decodificados formam uma palavra que tem a ver com o tema do episódio. Esses códigos são imagens que aparentam algo estranho e sobrenatural, assim como a própria série. Eles são: •Uma forma do rosto de uma mulher em fumaça ; • Uma série de números na cauda de um lagarto, além da letra grega Phi e da sequência de Fibonacci em espiral; •Fetos no lugar de sementes em uma maçã; •Uma mão de seis dedos; •A letra grega Phi nas costas de um sapo; •Uma asa de uma libélula no lugar de petálas em uma flor; • Um cavalo-marinho com a sequência de Fibonacci em seu corpo; •Uma borboleta com asas feitas de ossos humanos; • Uma folha com a letra grega delta desenhada, além de haver uma diferença de tamanho entre a ponta da folha e o resto da mesma, sugerindo que cada parte da folha seja de diferentes universos. Em quase todos os posters da primeira temporada, há pontos amarelos, que ajudam a decodificar a mensagem secreta de cada episódio. Apesar desses códigos não alterarem a história, eles aparecem em vários episódios na série, como, por exemplo, no episódio da segunda temporada "Johari Window", na qual uma borboleta foi essencial para a resolução do caso, ou no episódio "The Bishop Revival", na qual há uma forma de um cavalo-marinho numa linhagem de DNA. No episódio "Jacksonville", na cena em que Walter explica para Olivia como a droga cortexiphan funciona, todos os glifos podem ser vistos atrás de Walter.

But that"s the price we pay when we living on the other side.
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